从种子萌芽到3～5叶期的幼苗多发，病芽种子根变褐腐烂，可扩展到中胚轴，严重时幼芽烂死。幼苗初生根皮层坏死，变黑褐色，根毛减少，无次生根或仅有少数次生根。茎基部水浸状腐烂，可使茎基部节间整齐断裂。叶鞘变褐、撕裂，叶片变黄，叶缘枯焦，心叶卷曲易折。通常无次生根的病苗死亡，枯死苗近地面处产生白色或粉红色霉状物。有少数次生根的成为弱苗，底部叶片的叶尖发黄，并逐渐向叶片中下部发展，最后全叶变褐枯死。病苗发育迟缓，生长衰弱。严重时各层叶片黄枯或青枯。苗枯病是丝瓜的重要病害，重病田往往因病缺苗3～5成。除镰刀菌外，腐霉菌、丝核菌、蠕孢菌等也能引起苗病，多种病原菌可混合发生。