小麦病害包括赤霉病、白粉病、锈病、叶枯病、纹枯病、黑穗病、根腐病、全蚀病(立枯病、黑脚病)以及病毒病。小麦虫害涉及蚜虫、吸浆虫、麦蜘蛛(红蜘蛛)、粘虫、飞虱、麦叶蜂、胞囊线虫和地下害虫(金针虫、蛴螬、地老虎)。