黄瓜病虫害主要有霜霉病、灰霉病、白粉病、病毒病、细菌角斑病、根结线虫、白粉虱。霜霉病发病症状为叶背面有水浸状、多角形病斑、病斑上有灰霉层，可选用普力克、安克、灭克、抑快净、霜脲锰锌、金雷多米尔和阿米西达等药物进行治疗，在防治霜霉病时，要注意细菌性角斑病的同时发生，可以在防治霜霉病的药剂中，加入防治细菌性角斑病的药剂。
黄瓜立枯病症状是：幼苗出土即可受害，但多发生于幼苗中后期，茎基部产生暗褐色椭圆形病斑。初期病苗白天或中午萎蔫，夜晚至第2天早晨能恢复正常。病斑逐渐凹陷，扩大后绕茎1周，幼苗基部干缩，地上部茎叶枯死。潮湿时，病斑出现褐纹或长有稀疏的灰褐色蛛丝状菌丝。由于病苗直立不倒伏，故称立枯病。其特点是受害幼苗茎基部产生椭圆形暗褐色病斑，带有轮纹，前期病苗白天萎蔫，夜晚恢复，病斑逐渐凹陷。湿度大时产生淡褐色蛛丝状霉，但不明显，病部没有白色棉絮状霉。病斑逐渐扩大后绕茎一周，甚至木质外露，最后病部收缩干枯，叶片萎蔫不能恢复原状，幼苗不呈猝倒伏状，逐渐干枯死亡。地下根部皮层变褐色或腐烂，但不易折倒，病部具轮纹状或淡褐色网状霉层。
在发病初期，在下胚轴或茎基部出现近圆形或不规则形的暗褐色斑，病部向里凹陷，扩展后围绕一圈致使茎部萎缩干枯，造成地上部叶片变黄，最后幼苗死亡，但不倒伏。黄瓜患有立枯病后，在根部受害多在近地表根颈处，皮层变褐或腐烂。在苗床内，发病初期零星瓜苗白天萎蔫，夜间恢复，经数日反复后，病株萎蔫枯死，早期与猝倒病相似。病情扩展后，病株不猝倒，病部具轮纹或稀疏的淡褐色蛛丝状霉，且病程进展较慢，有别于猝倒病。黄瓜立枯病多发生在育苗的中、后期。