辣椒疫病属真菌性病害,病菌在病残体或土壤及种子上越冬,通过雨水飞溅和灌溉水进行传播。疫病的病原菌的卵孢子可存活3年以上,主要以卵孢子在土壤中和病残体上越冬,可度过不种植寄主作物的季节。在适宜的温度和湿度条件下,卵孢子开始萌发,产生游动孢子,侵入辣椒的根部、茎基部、叶部。在辣椒生长期间,病株陆续产生孢子囊和游动孢子,主要随灌溉的水和雨扩散传播,发生多次再侵染。病原菌还可通过风雨吹溅和农事操作而传染,引起叶、枝、果发病。