病菌主要以分生孢子和菌丝体在稻草和稻谷上越冬。翌年产生分生孢子借风雨传播到稻株上，萌发侵人寄主向邻近细胞扩展发病，形成中心病株。病部形成的分生孢子，借风雨传播，进行再侵染。播种带菌种子可引起苗瘟。水稻种子带菌会导致叶瘟；寄生在原干燥稻草上的菌丝分化孢子，通过气流传播，在水稻分蘖期、抽穗破口期和花期等薄弱期形成叶瘟、节瘟、穗颈瘟和谷瘟。种子和田间残留稻草带菌、田间湿度大、偏施氮肥是稻瘟病的发病原因。病原物的存在、种子和病稻草带菌、适温高湿等条件适宜时，孢子借风雨、气流传播。阴雨连绵，日照不足或时晴时雨，早晚有云雾或结露条件，病情扩展迅速。同一品种在不同生育期抗性表现不同，秧苗4叶期、分蘖期和抽穗期易感病，圆秆期发病轻，同一器官或组织在幼嫩期发病重。穗期以始穗时抗病性弱。放水早或长期深灌根系发育差，抗病力弱发病重。光照不足，田间湿度大，有利分生孢子的形成、萌发和侵入。山区雾大露重，光照不足，稻瘟病的发生为害比平原严重。偏施迟施氮肥，不合理的稻田灌溉，均降低水稻抗病能力。