水稻白叶枯病菌主要在稻种、稻草和稻桩上越冬，重病田稻桩附近土壤中的细菌也可越年传病。播种病谷，病菌可通过幼苗的根和芽鞘侵入。病稻草和稻桩上的病菌，遇到雨水就渗入水流中，秧苗接触带菌水，病菌从水孔、伤口侵入稻体。用病稻草催芽、覆盖秧苗、扎秧把等有利病害传播。早、中稻秧田期由于温度低，菌量较少，一般看不到症状，直到孕穗前后才暴发出来。病斑上的溢脓，可借风、雨、露水和叶片接触等进行再侵染。
水稻叶枯病是由媒介昆虫灰飞虱传播的一种毁灭性病毒病，具有间歇流行的特点。20世纪60年代和80年代，该病曾在江苏省部分地区流行。带菌种子、带病稻草和残留田间的病株稻桩是主要初侵染源。李氏禾等田边杂草也能传病，细菌在种子内越冬，播后由叶片水孔、伤口侵入，形成中心病株，病株上分泌带菌的黄色小球，借风雨、露水、灌水、昆虫、人为等因素传播。病菌借灌溉水、风雨传播距离较远，低洼积水、雨涝以及串灌漫灌可引起连片发病。晨露未干病田操作造成带菌扩散。
高温高湿、多露、台风、暴雨是病害流行条件，稻区长期积水、氮肥过多、生长过旺、土壤酸性都有利于病害发生。一般中稻发病重于晚稻，籼稻重于粳稻，矮秆阔叶品种重于高秆窄叶品种，不耐肥品种重于耐肥品种。水稻在幼穗分化期和孕穗期易感病。
水稻白叶枯病的防治必须因地制宜，综合实行各种有效的防治措施。综合防治策略是：以抗病品种为基础，秧田期预防为重点，在控制菌源前提下，加强农业措施（着重肥水管理），辅以药剂防治。高温高湿有利于病菌显示其毒力，偏施氮肥稻株抗性低，温度降低时病害轻，20℃以下不表现症状。长期积水或受淹的田块发病早而重。水稻种植应注意及时预防虫害与加强田间管理工作。