发病初期，可选用70%甲基托布津可湿性粉剂600倍液，或75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或60%防霉宝超微可湿性粉剂800倍液，或80%大生可湿性粉剂800倍液喷雾。也可用5%百菌清粉尘剂，或5%加瑞农粉尘剂，每亩用药1公斤于早晨或傍晚喷粉。隔7～10天喷1次，喷药次数视病情而定。
注意蔓枯病，用苯咪甲环唑，苯甲嘧菌酯吡唑醚菌酯，辛菌胺，咪鲜胺锰盐，苯甲丙环唑等药加氨基酸叶面肥交替使用喷雾或者涂抹防治。
苦瓜蔓枯病可用75%百菌清可湿性药剂或70%甲基托布津可湿性喷雾阿治。
西瓜蔓枯病主要破坏输导组织，对西瓜生产影响很大，培育壮苗，实行轮作或土壤消毒，控制氮素，增施磷钾或有机肥，发病期喷雾多菌灵，百菌清，甲霜恶霉灵或恶霉乙蒜素等防治。
生产实践证明，防治苦瓜蔓枯病选择阿米妙收、露娜森等药剂喷雾防治效果相对较好，没有特效药。