马铃薯薯块受害症状：由脐部开始，呈放射状向髓部扩展，病部黑褐色或黑色，横切检查维管束呈黑褐色点状或短线状，用手挤压皮肉不分离。病轻时，脐部只呈黑点状，干燥时变硬、紧缩；但在长时间高湿度环境中，薯块变为黑褐色，腐烂发臭，严重时薯块中间烂成空腔。
马铃薯幼苗受害症状：一般在株高15-18厘米时出现症状，表现为植株矮小，生长衰弱，节间缩短，病株易从土中拔出，拨出后茎基部往往带有母薯腐烂物。发病部位茎秆常常自动开裂，横切茎可见维管束为褐色，并分泌出大量的臭味粘液；同时叶片上卷，褪绿黄化，茎部变黑，萎蔫而死。如果病害发展较慢时，植株逐渐枯萎，结果部位上移，易长气生块茎。
马铃薯黑胫病从苗期到生育后期均可发病，主要为害植株茎基部和薯块。当幼苗生长到15-20厘米开始出现症状，表现植株矮小，叶色褪绿黄化，节间短缩或叶片上卷，茎基以上部位组织发黑腐烂，最终萎蔫而死。