病原菌以菌丝体或厚垣孢子在土壤、栽培基质中或附着在种子上越冬，可营腐生生活。病株根或茎的腐烂处在潮湿环境中产生子实体，孢子借气流、雨水、灌溉水的泼溅传播，通过幼根和茎基部或扦插苗的伤口侵入为害。
病菌的侵染常与高温、地面积水、连阴雨或暴雨后骤晴有关。特别是雨后暴晴可能引起病害在2-3个小时内突然暴发。但此病的发生也和韭菜生长势有关，株龄过老，生命力减退，或收割过早，收割次数过多，鳞茎、根茎内贮积养分少，或培土过高等，都易发生此病。
病株根或茎的腐烂处在潮湿环境中产生子实体，孢子借气流、雨水、灌溉水的泼溅传播，通过幼根和茎基部或扦插苗的伤口侵入为害。