引起玉米穗腐病的20多种霉菌会附着在玉米的种子、根茬、茎秆、穗轴等病残体上，经过冬季后，第二年遇阴雨潮湿环境，病菌的子囊孢子迅速生长成熟，随风飞散，落在玉米花丝上引发病害。夏季多雨潮湿，温度在25℃以上，湿度达80%时，穗腐病易流行，常伴随虫害发生。收获后玉米入库时若未充分降水风干，含水量偏高，加上仓库密封不良、温度过高，易导致霉菌腐生蔓延，引起玉米粒腐烂或发霉。病菌以分生孢子、菌丝体在种子、病残体上越冬，成为初侵染源，次年借风雨传播。穗腐病的发生与田间湿度及害虫情况密切相关，吐丝至成熟期降雨多、湿度大，或玉米螟、棉铃虫危害严重的地块，穗腐病发生较重。