大葱常见病害包括紫斑病、锈病、菌核病、黄矮病、霜霉病、灰霉病、软腐病、黑斑病、病毒病、炭疽病、疫病、猝倒病、沤根、白色斑点病、褐斑病叶腐病、葱线虫病等。主要的虫害有葱蛆、葱蓟马、斑潜叶蝇、斜纹夜蛾、甜菜夜蛾等。
