在番茄褐色根腐病发病初期,可使用10%双效灵200倍液、50%托布津400倍液或12.5%增效多菌灵200倍液喷布植株茎基部及周围土表,或进行药液灌根。此外,也可喷洒75%百菌清可湿性粉剂500倍液、70%甲基托布津800倍液、45%特克多悬浮剂1000倍液、47%加瑞农可湿性粉剂600倍液、50%苯菌灵可湿性粉剂1000倍液、50%多菌灵或50%甲基硫菌灵可湿性粉剂500倍液、80%炭疽福美800倍液或25%施保克3000倍液。每7至10天1次,连防2至3次,采收前7至10天停止用药。