以早期预防为主，掌握好用药的3个关键时期，即苗期、初花期、果实膨大期。(1)苗期：定植前在番茄苗床用奥力克—霉止700倍液喷施，选择无病苗移栽。(2)初花期：第1穗果开花时，用奥力克—霉止700倍液喷施，5—7天用药一次，进行预防。(3)果实膨大期：在浇催果水(尤其在浇第一、二穗果催果水)前一天进行奥力克—霉止500倍液喷雾防治，5—7天用药一次，连用2—3次。
充分利用具有灰葡萄孢霉病菌拮抗作用的微生物源物质抑制灰霉病的发生，可避免病菌产生抗药性，具有无毒无害、安全环保、长期控制等优点。目前防治灰霉病的拮抗菌有木菌素、螺卷毛壳、单格孢属、芽孢杆菌、白肽霉素、变构霉素、链霉素等。