玉米缺磷时，嫩株对磷的缺乏特别敏感，表现为植株矮化，叶尖和叶缘失绿并呈现紫红色，随后叶端枯死或变为暗紫褐色。这种现象是由于玉米植株体内糖代谢受阻，导致叶中糖分积累，促进花色素苷的形成，使植株呈现紫色。在苗期，缺磷的玉米茎和叶片会呈现暗绿带紫红色，从下部叶片开始，叶尖干枯，沿叶缘向基部蔓延，进而变为暗褐色，并逐渐影响幼嫩叶片。同时，根系发育不良，茎部衰弱且细长。到了孕穗至开花期，缺磷会阻碍糖代谢与蛋白质合成，导致雌穗减少，分化发育不良，花丝延迟抽出，授粉受阻，受精不良，籽粒不充实，甚至出现空穗。此外，果穗会卷曲，穗顶缢缩，出现秃顶、缺粒与粒行不整齐的现象。