番茄空洞果和畸形果发生原因是激素药浓度过大，或者重复使用，低温或者高温，造成果实发育不良。空洞果发生的情况有三点：一是夜间温度过低，导致果实内部发育不完全，形成空腔。二是氮肥的使用过多，三是缺少二氧化碳或是光照条件差，导致光合产物不足。畸形果发生原因：花芽分化和发育时水分和养分供应过于充足，或是温度连续在6摄氏度左右的低夜温或20度的高温，容易诱发番茄畸形果。
