水稻苗期常见病害有恶苗病和基腐病，虫害主要为稻飞虱。此外，水稻在生长过程中还会遭遇稻瘟病、黑条矮缩病、纹枯病、稻曲病、穗腐病、白叶枯病、胡麻叶斑病、根结线虫病、细菌性基腐病等病害。虫害方面，水稻可能受到稻纵卷叶螟、二化螟、三化螟、大螟、稻秆潜蝇、稻瘿蚊等侵害。
