水稻缺磷症状表现为生长缓慢，植株矮小，茎叶细狭，叶片直挺，丛顶整齐，呈“一炷香”株型，分蘖显著减少甚至不分蘖。叶色变深，呈暗绿色、灰绿色或灰蓝色，叶尖及叶缘常带紫红色，且叶片无光泽。老叶出现红褐色不规则斑点，或沿着叶脉出现褐色条斑，形成赤枯症。根系细而短，分枝侧很少，扎根浅，根量比正常苗少，严重缺磷时根系腐烂发黑。抽穗和成熟期延迟，每穗枝梗数和粒数减少，千粒重下降，产量降低。缺磷常在生育前期形成僵苗，表现为生长缓慢，不分蘖或延迟分蘖，秧苗细弱不发根。叶形狭长，叶片小，叶呈环状卷曲。老根变黄，新根少而纤细，严重时变黑腐烂。成熟期不一致，穗小粒少，千粒重低，空壳率高。还易引起胡麻叶斑病；抽穗、成熟延迟，减产严重。