西葫芦软腐病主要为害西葫芦的根茎部及果实。根茎部受害，髓组织溃烂，湿度大时，溃烂处流出灰褐色黏稠状物，轻碰病株即倒折。果实受害，幼瓜染病，病部先呈褐色水浸状，后迅速软化腐烂如泥。该病扩展速度很快，有些病瓜从发病到整果腐烂仅几天时间，有些幼瓜今天发病，24小时后即见烂掉，病瓜散出臭味是识别该病的重要特征。
西葫芦茎基部细菌性软腐病主要为害植株的茎基部。发病初，病菌从西葫芦茎基部的表皮或伤口侵入，在离地面3-5cm的茎基部形成不规则水渍状褪绿斑，逐渐扩大后呈黄褐色，病部向内软腐。
西葫芦软腐病主要危害瓜条和根茎部，病菌多从伤口处侵染，初期呈水渍状灰白色坏死，继而软化腐烂，散发出臭味。此病发生后病势发展迅速，瓜条染病后在很短时期内即全部腐烂。