苹果褐腐病又称苹果菌核病，是由果生核盘菌侵染所引起的、发生在苹果上的病害。主要在苹果成熟期和贮藏期发生，主要危害果实，也危害花和果枝。若采收后贮藏感染了病原体的果实，发病后会造成较为严重的损失。
病菌可经皮孔侵入果实，但主要是通过各种伤口侵入，刺伤、碰压伤和虫伤果以及裂果容易受害。果实近成熟期9月下旬至10月上旬为发病盛期。贮藏期内，病果上的病菌可以蔓延侵害相邻的无伤果实。病害的流行主要和雨水、湿度有关，多雨高温条件下发生较重。在贮藏运输过程中，由于挤压、碰撞，常造成大量伤口，高温高湿，病害会迅速传播蔓延；贮藏期病果上的病菌也可侵害相邻果实，使其发病。
主要以菌丝和孢子在病果（僵果）上越冬，翌年春分生孢子借风雨传播，通过伤口或皮孔侵入果实，潜育期5～10天。在贮运中，病害主要通过病健果接触传病。温度和水分是影响分生孢子萌发和侵染的主要因素，寄主体表保持潮湿的持续时间起决定作用，温度则影响萌发和侵染进程的速率。降雨后产孢也多。褐腐菌最适发育温度25℃，但在较高或较低温度下病菌仍可活动扩展。湿度是该病流行的重要因素。高湿度不仅利于病菌的生长、繁殖，孢子的产生、萌发，还可使果实组织充水，增加感病性。
果园管理差、病虫害严重、裂果或伤口多等均可导致褐腐病发生，特别是果树生长前期干旱，后期多雨，褐腐病会大流行。