西葫芦病毒病防治以防为主，治疗为辅，结合园艺措施、生态调控、理化诱控、生物防治，辅以科学用药防治。西葫芦病毒病的防治措施包括：选用抗病品种、种子消毒、实行轮作、培育壮苗、消灭蚜虫、减少接触、加强肥水管理、药剂防治。
1.泥浆选种：通过泥浆选种剔除带有病毒的种子，因为带有病毒的种子比正常种子为轻。
2.药剂消毒：浸种后用10％的磷酸三钠浸泡20-30分钟，用清水冲洗后再进行催芽。
3.清理杂草：消除田间或温室内的杂草，减少病毒寄生。彻底治蚜，消除传毒介体。加强肥水管理，培育健株，提高植株的抗病能力。
4.药剂防治：用抗病威600-800倍液，或用病毒必克600-800倍液，或抗毒剂1号对300-400倍液喷雾，并结合灌根。也可每7-10天喷1次5毫克／升的萘乙酸溶液，连喷2-3次。