茄子根腐病是一种土传性病害，因此在种植时应将种子和土壤进行消毒再育苗，定植后使用强力生根剂促进生根壮根。如果出现病情，及时使用咯菌腈悬浮剂加精甲霜锰锌水分散颗粒剂进行浇灌防治。选择抗病品种，进行2-3年以上与非茄科作物轮作，以减少初侵染源。对保护地栽培茄子，应加强温湿度管理，适时通风，适当控制浇水，并及时排湿。发病初期喷药，常用农药有40%杜邦新星乳油9000倍液、65%甲霜灵可湿性粉剂1000倍液、50%多菌灵可湿性粉剂800倍液、47%加瑞农可湿性粉剂800至1000倍液。每亩用药量60至65升，每隔十天左右防治一次，连续防治两至三次。