在发病初期选择晴天喷药，常用药剂有50%灭菌灵可湿性粉剂800倍液，50%利得可湿性粉剂600～800倍液，50%扑海因可湿性粉剂500～600倍液，50%多菌灵可湿性粉剂800倍液，50%甲基托布津可湿性粉剂500倍液，77%可杀得可湿性粉剂500倍液，每隔7天防治1次，共防治3～4次。棚室栽培，每亩用5%百菌清粉尘剂1kg，或45%百菌清烟剂200g熏烟，每隔9天左右防治1次，连续或交替施用2～3次。使用甲基硫菌灵加苯醚甲环唑或戊唑醇或咪鲜胺锰盐喷雾防治。芹菜叶斑病可以用多菌灵、甲基扎布津等药物防治。防治芹菜叶斑病，首先要选种抗病品种、培育无病壮苗，其次要合理轮作倒茬、建立科学合理的耕作制度，第三要加强田间管理、防止田间积水、控制田间湿度，第四要在初发病时用腐霉利、瑞毒霉、吡唑醚菌酯、腈菌唑等农药田间交替喷雾防治。