果桑菌核病的发生受多种因素影响。气候条件是关键因素之一，雨水多、土壤湿润、气温高有利于土壤中的病菌萌发，进而促使菌核病爆发。施肥不当也会增加病害风险，偏施氮肥会导致树体虚旺，细胞不紧密，树体营养不足，抗病性差，同时造成土壤板结、酸化，降低有益微生物活性，为病原菌繁殖提供条件。此外，幼嫩组织最易感病，果桑在开花期和整个结果期都可能感染菌核病，但以开花前后感染最多，青果期感染相对较少，成熟果桑不感染。子囊孢子萌发温限为0～35℃，5～10℃萌发最快，该菌能侵染41科200余种植物。春季低温、多雨时茎腐重，花期多雨时盘腐重。适当晚播，错开雨季可减轻病害。连作田土壤中菌核量大，病害重。