菌核病一般是在幼苗期容易产生，通常到了重病时期才会发现，会导致根茎腐烂。同时，茎秆也会出现浅褐色的凹陷病斑，后来逐渐变成白色。潮湿的时候内部还会长出一些黑色菌核，受害较轻时，会导致发育不良或烂根、植株矮小、产量降低，受害严重的时候，直接会导致植株枯死。幼苗期轻病株无明显症状，重病株根茎腐烂并生白霉，大田栽植后病情不断扩展，至抽薹后达高峰。病株茎杆上出现浅褐色凹陷病斑，后转为白色，终致皮层朽腐，纤维散离成乱麻状，茎腔中空，内生黑色鼠粪状菌核。在高湿条件下，病部表面长出白色棉絮状菌丝体和黑色菌核。
