一是用脱毒薯块作种，二是合理轮作制度，三是科学配方施肥，四是在幼苗期运用杀菌剂提前预防。
前期喷施保护性的杀菌剂如代森锰锌、乙磷铝、双炔酰菌胺等，后期雨季（7~8月）来临后主要喷施内吸性治疗剂或保护兼治疗剂。根据预测预报或气象条件，在中心病株出现前7~10天喷施第一次保护性杀菌剂，如代森锰锌和双炔酰菌胺等。若到雨季喷施内吸性治疗剂或保护兼治疗剂，如霜脲氰与恶唑菌酮、丙森锌、代森锰锌等复配制剂、松脂酸铜、金雷多米尔、银法利、“增威赢绿”等，注意交替用药。根据降雨情况每隔7-10天喷施一次。
防治方法1.种薯处理：用75%百菌清可湿性粉剂800-1000倍液对种薯进行均匀喷雾，处理后的种薯要进行晾晒，使薯块切面没水分后再进行播种。2.田间防治：物理防治：在马铃薯开花前后，田间发现中心病株后，立即拔除深埋。化学防治：可使用克露100克/亩全田均匀喷洒，进行预防保护性防治。用25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液或65%代森锌可湿性粉剂500倍液，每隔7-10天喷药1次，连续喷药2-3次。根据病情发生风险的大小可适当调整用药次数。
发病初期用防菌药剂如代森锌可湿性粉剂防治。
如何防治马铃薯晚疫病，一选择利于排水的地块，二执行深沟高厢双行垄作，三发病时用银法利防治。
1、加强田间管理，马铃薯结薯后多次培土以成高垄，以减少薯块受侵染的机会。加强田间巡查，发现晚疫病中心病株及时清除，降雨后及时做好清沟排水工作，切忌薯地积水。2、化学防治。
选用抗病品种，提倡小整署播种，轮作倒茬，马铃薯开花前后用杀菌剂防治。
加强田间管理，用霜脲氰，丙森锌等交替用药。