大豆花叶病严重损害叶片，导致叶片退绿黄化。病株矮化，叶片呈现黄绿相间的花叶并皱缩，叶缘下卷或扭曲，质地硬脆，叶脉变褐，有时沿叶脉两侧出现疱状突起。嫩叶症状明显，老叶常无症状。带毒种子长出的植株或早感病植株在3-4叶期即可显现症状。高度感病品种除典型症状外，还会出现顶芽或侧芽变褐、萎蔫、枯死及叶片上产生坏死小点等症状。重病株不结实或结实极少。抗病品种通常仅表现轻微花叶症状或带毒不显症。
