病菌主要以菌丝体在田间病残体上越冬，在土壤中至少可存活3年，是次年初次侵染的主要来源。种子表面可带菌，但内部不带菌，播种带菌的种子会导致病苗。病原在植株生长期间通过分生孢子经流水、农具等传播，从伤口侵入须根，再扩展至主根，在维管束组织的导管中生长发育并向上蔓延。田间以结荚期发病较多，现蕾至结荚期为发病盛期。土壤含水量低于65%、缺肥及酸性土壤发病重。
蚕豆枯萎病的侵染循环中，病菌主要以大田内病株残体上的菌丝、分生孢子座或厚垣孢子在土壤中越夏或越冬，成为第二年初侵染的主要来源，病残体上的病菌在土壤中至少可存活2年以上。病田收获的种子、带菌的肥料、灌溉水可能传病，但不是主要途径。病菌直接或经伤口侵人主根、侧根的根尖及茎基部，导致根部发黑、皮层被腐蚀，主根心髓变成锈褐色，随着病情加剧，病菌沿茎的中轴向上蔓延，至蚕豆生长后期可上升到茎的2/3部位。耕作的农具和水可在田间传播。蚕豆收获后，病菌又随病残体在土壤中越夏或越冬。