成熟的病菌孢子通过气流、风雨传播，落在花器凋萎的花药上萌发，先营腐生生活，然后侵染小穗，几天后产生大量粉红色霉层。小麦赤霉病的传播主要有三种途径：首先是种子传播，感染过赤霉病的地块不能再留种，病菌会在种子中生存，带病的种子再次播种后会继续出现赤霉病。其次是田间患病的残株，感染赤霉病的地块在小麦收获后，病残体掉落在田间，病菌会在这些病残体上越夏，下茬作物播种后提供腐生生活的场所，继续危害小麦。最后是路边的杂草，杂草也是赤霉病病菌藏匿的场所，在杂草中越冬、越夏，来年小麦播种后，病菌随风雨传播，危害小麦。