小麦条锈病主要危害叶片，其次是叶鞘、茎秆，也侵染穗部、颖壳和芒等组织。在苗期生长阶段感染条锈病之后，叶片上会产生多层轮状分布的夏孢子堆。成株感染后，叶脉上出现椭圆形夏孢子堆和鲜黄色长条子堆，叶片破裂后产生粉状物体。接近成熟期时，叶鞘上出现圆形夏孢子堆和黑褐色卵圆形孢子堆，后期出现短线状黑色冬孢子堆。发病初期，叶片上产生大量黄色粉孢，与叶脉平行排列成条状，后期表皮破裂，出现锈色粉状物。
