玉米南方锈在气温26℃到28℃，湿度大时容易发病。
玉米南方锈病是热带和亚热带玉米种植地区最常见的病害，夏季，病原菌的夏孢子随暖湿气流从南向北传播，造成北方地区的发生流行。玉米南方锈病症状与普通锈病相似，在叶片上初生褪绿小斑点，很快发展成为黄褐色突起的疱斑，之后病斑表皮破裂散出铁锈色粉状物，即病原菌夏孢子堆，散生于叶片的两面，以叶面居多。发生严重时，叶片上布满孢子堆，叶片从受害部位折断，全株干枯，植株早衰，影响叶片的光合作用和籽粒的灌浆成熟，造成玉米减产。该病害主要为害叶片和叶鞘，严重时侵染苞叶和雄穗组织。
玉米南方锈病发病条件主要是气候因素和病原数量及感病品种。
玉米生长在潮湿阴暗，不通风田地，易患锈病。
玉米南方锈病种植感病品种有利于病害发生。杨花期雨水多，有利于病害流行。在南方地区如果冬季温度过暖，病原菌越冬的茵量增大，病害流行的风险增高。在北方地区夏季降雨发生的早的年份，夏孢子来的早，病害的风险性就会更高。因为第一次侵染在一个生长季里发生的越早，病害流行的风险越高。夏天玉米生长季节中降雨量降雨次过高，这个病的风险增大。