小麦赤霉病是典型的气候流行性病害，具有流行频率高、危害大、损失重的特点，从苗期到穗期都可发病，引起苗枯、穗枯和茎基部腐烂。其中穗枯最为普遍，一般一个穗上有一个或多个小穗发病，颖片上出现水渍状淡褐色病斑，潮湿时产生粉红色霉层，发生严重时，半穗或整穗枯死。
防治方法主要是以选用抗菌品种为基础，以药剂拌种作为重要措施，以农业防治紧抓不放，以化学防治为重点，将小麦赤霉病控制好、防治好，确保小麦丰产丰收。清除带病秸杆，重病区应尽量清除掉带病的小麦、玉米秸杆，同时进行深耕灭茬，消灭田间病菌。
在初花期施药，5到7天后再施一次。建议在小麦扬花期结合一喷三防使用戊唑醇或丙环唑或己唑醇或氟环唑喷雾防治。小麦的赤霉病，可防可控不可治，建议在小麦的抽穗到扬花期，喷施戊唑醇或烯唑醇或甲基硫菌灵防治和预防。赤霉病要提前预防，在小麦抽穗扬花期使用苯醚甲环唑，丙环唑，唑醚·氟环唑，嘧菌酯等药剂防治。
选用耐病品种种植，在播种前用增产菌剂拌种，晾干后再播种；还可以在扬花初期，每亩用25%氰烯菌酯悬浮剂100-200毫升，或者40%戊唑·咪鲜胺水乳剂20-25毫升进行喷雾防治，每隔7天交替用药1次。