病菌在被害枝条组织中越冬，翌春病组织内细菌开始活动，梅花开花前后，病菌从病组织中溢出，借风雨或昆虫传播，从叶片的气孔、枝条的芽痕侵入，潜育期7-14天。春季溃疡斑易干燥，外围的健全组织很容易愈合，所以，溃疡斑中的病菌在干燥条件下以10-13天即死亡。气温19-28℃，相对湿度70-90℃利于发病。该病一般于5月间出现，7-8月发病严重。
桃树细菌穿空病的发病条件相对湿度90利于发病。
