西红柿脐腐病的发生主要原因是果实膨大期间，尤其是开花后钙素供应不足。土壤过于干燥、地温过高、氮肥过量以及酸性土壤都会阻碍根系对钙的吸收，从而引发此病。同时，水分供应失调也被认为是诱发本病的关键因素。在干旱条件下，果实的水分被叶片夺取，导致果实突然大量失水，进而造成果实脐部组织坏死，形成脐腐。
