绵腐病主要发生在3叶期前长期淹水的湿润苗床。播种后若遇到低于10℃的低温，秧苗根系活力会减弱，导致其吸水吸肥能力下降，进而引起根系生长缓慢，降低秧苗的抗性。此时病菌容易侵入，对秧苗进行浸染，造成烂秧。此外，低温、床土湿度过大以及通风透光不良也是绵腐病发生的关键因素。
