黄瓜猝倒病发病多是在低温阴雨天阳光少，与表面土壤接近的茎基部被病菌从比较薄的细胞壁侵入，发现时多已经变成黄褐色或收缩成线状倒下。因病菌生长适宜地温为15~16℃，温度高于30℃时病菌生长会受到抑制，所以黄瓜猝倒病适宜发病地温在10℃左右，此温度对黄瓜生长不利，但病菌能活动，尤其育苗期在低温、高湿情况下，最利于发病。在幼苗子叶养分基本消耗完、新根尚未扎实之前为感病期，这时真叶未抽出，碳水化合物得不到快速积累，抗病能力弱，如果此时遇到雨、雪连阴天或寒流侵袭，地温降低，光合作用较弱，在这种情况下，黄瓜苗呼吸作用增强，光合作用产物主要是碳水化合物）消耗加大，致使黄瓜苗的幼茎细胞伸长，细胞壁变薄而易受病菌侵袭。因此，黄瓜猝倒病主要在黄瓜幼苗长出1~2片真叶容易发生，当长出3片真叶后，发病率会大大降低。黄瓜猝倒病的发病原因主要是低温多雨、土壤湿度过大或过粘造成的。