玉米柄锈菌喜温暖潮湿的环境，发病温度范围15-35℃，最适环境温度为20-30℃，相对湿度95%以上。夏孢子在侵入时需高湿，叶面结露，适宜于夏孢子形成和侵入。中国上海及长江中下游地区玉米锈病的主要发病盛期在5-10月，年度间夏秋高温、多湿及多连阴雨的年份发病重。田块间连作地排水不良的田块发病较重。栽培上种植早熟品种、密度过高、通风透光差、偏施氮肥的田块发病重。
