选择抗病品种种植,进行合理轮作,并对土壤和种子进行消毒处理,以培育壮苗。在发病初期,应及时喷施氢氧化铜、噻菌铜或噻霉酮等防治措施。芹菜软腐病主要通过土壤传播,重茬地的土壤中易积累大量病菌,因此连茬种植会导致病害发生和病情加重。为避免这种情况,应实行两年以上的轮作。