黄瓜枯萎病的防治方法主要以农业防治和化学防治为主。首先对种子进行消毒，合理轮作，施足底肥，高垄栽培；其次选用基质穴盘嫁接育苗，加强田间管理；最后结合化学药剂进行防治。发病前或发病初期，用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，每株灌兑好的药液0.3～0.5升；或12.5%增效多菌灵浓可溶剂200～300倍液，每株100毫升，隔10天后再灌1次，连续防治2～3次，一定要早防、早治，否则效果不明显。此外，于定植后开始喷洒液体法生产的细胞分裂素500～600倍液，隔7～10天1次，共喷3～4次，可明显提高抗性，如能加入0.2%磷酸二氢钾，或0.5%尿素或喷洒喷施宝每毫升加水11～12升、或植宝素7500倍液效果更好。发病初期可用甲基托布津500倍液或70%敌克松1000倍液在植株病根周围浇灌，每株使用药液250毫升，每隔7天灌根1次。