病菌以菌丝体或子座及分生孢子器在病部越冬，翌春核桃树液流动后遇有适宜发病条件产出分生孢子，分生孢子通过风雨或昆虫传播，从嫁接口、伤口等处侵入，病害发生后逐渐扩展。生长期可发生多次侵染，春秋两季为一年的发病高峰期，尤其是在四月10日~20日至五月20日~30日危害最重。一年中春秋两季为腐烂病高发期，春季3-5月份，秋季7-9月份。通常核桃进入结果期后，腐烂病开始发生，随着树龄的增加和产量的不断提高，腐烂病会逐年增多，在正常管理的情况下，树体的负载量是影响发病的一个关键因素。连年结果要消耗大量养分，如果养分供给不足，必然导致腐烂病的发生。另外，对于新移植的核桃树和前茬作物是杨树的林子所栽植的核桃树腐烂病的发生都比较普遍和严重。核桃腐烂病一般发生在管理粗放、土层瘠薄、排水不良、肥水不足、树势衰弱或遭受冻害及盐害的地块上，造成枝条枯死，结果能力下降，严重时引起整株死亡。