该菌主要通过雨水、灌溉水及农具传播，病薯块及带菌肥料也可带菌。病菌从根部或茎基部伤口侵入，在植株体内的维管束组织中扩展，造成导管堵塞及细胞中毒。番茄青枯病病原菌通过雨水、灌溉水、地下害虫、农事操作等方式传播，并沿维管束向上扩展，致使导管堵塞，整个组织被破坏从而失去输导功能。
