羊痘潜伏期5～6天，初起为红色或紫红色的小丘疹，质地坚硬，以后扩大成为顶端扁平水疱，能发展成出血性大疱或脓疱，中央可有脐凹，大小为2～3cm，最大可达5cm。疹块往往融连成片，几天后就开始脱落，导致呼吸困难，加速病羊死亡。山羊痘潜伏期6-8天，病初鼻孔闭塞、呼吸促迫，有的山羊流浆液或粘液性鼻涕，眼睑肿胀、结膜充血、有浆液性分泌物，体温升高到41-42℃，鼻孔周围、面部、耳部、背部、胸腹部、四肢无毛区、有两分至一元钱硬币大小的块状疹，疹块破溃后，有淡黄色液体流出，时间长了结痂。全过程约4周左右。山羊痘并发时呼吸道、消化道和关节炎症，严重时可引起脓毒败血症死亡。
病羊体温升高达41～42℃，结膜眼睑红肿，呼吸和脉搏加快，鼻流出黏液，食欲丧失，弓背站立，经1～2天后出现痘疹，痘疹多见于皮肤无毛或少毛处，先出现红斑，后变成丘疹再逐渐形成水疱，最后变成脓疱，脓疱破溃后，若无继发感染逐渐干燥，形成痂皮，经2～3周痊愈。发生在舌和齿龈的痘疹往往形成溃疡。有的羊咽喉、支气管，肺脏和前胃或真胃黏膜上发生痘疹时，病羊因继发细菌或病毒感染，而死于败血症。
初期，表现为坚硬的红色和蓝色的小丘疹，逐渐增大而形成平顶的脓血大疱，成熟的直径长为两公分，周围有红晕环绕，期间有灰白色或紫色，中央结痂。潜伏期5～6天，初起为红色或紫红色的小丘疹、质地坚硬，以后扩大成为顶端扁平的水疱、能发展成出血性大疱或脓疱，中央可有脐凹，大小为3～5cm。在24～48小时内疱破表面覆盖厚的淡褐色焦痂，痂四周有较特殊的灰白色或紫红色晕，其外再绕以红晕，以后变成乳头瘤样结节。最后变平、干燥、结痂而自愈。病程一般为3周，也可长达5～6周，获得永久性免疫。
皮疹数目不多，为单个或数个，好发于手指、前臂及面等暴露部位。除了局部有轻微肿痛外，无全身症状或仅有微热，局部淋巴结肿大。有些人在发病后2周，于躯干部出现一过性斑丘疹，亦可在四肢伸侧出现多形红斑样皮疹。
羊痘病毒主要存在于病羊的皮肤、黏膜的丘疹、脓疱、痂皮内及鼻黏膜分泌物中，在发病羊体温升高时，其血液中存有大量病毒，病羊为传染源，主要通过传染的空气经呼吸道感染，也可以通过损伤的皮肤或黏膜侵入机体。饲养管理人员、护理工具、皮毛产品、饲料、垫草及体外寄生虫都为传染媒介；绵羊中细毛羊比粗毛羊或土种羊易感染，病情严重；羔羊较成羊敏感，病死率高。气候寒冷、雨季、霜冻、枯草期和饲养管理因素都是发病和加重病情的诱因。
羊感染羊痘病毒后，皮肤上发生化脓性炎症，再传染给人，使人发生羊痘。羊痘病常见的症状是出现小丘疹，质地坚硬，随病情的逐渐发展形成出血性大疱或脓疱，最后变平、干燥、结痂而自愈。建议平时避免接触患羊痘的山羊或是绵羊。