剖检可见以各处粘膜和浆膜出血，特别是腺胃乳头和贲门部出血。心包、气管、喉头、肠和肠系膜充血或出血。直肠和泄殖腔粘膜出血。卵巢坏死、出血，卵泡破裂性腹膜炎等。消化道淋巴滤泡的肿大出血和溃疡是ND的一个突出特征。消化道出血病变主要分布于：腺胃前部－食道移行部；腺胃后部－肌胃移行部；12指肠起始部；12指肠后段向前2～3cm处；小肠游离部前半部第一段下1/3处；小肠游离部前半部第二段上1/3处；梅尼厄氏憩室(卵黄蒂)附近处；小肠游离部后半部第一段中间部分；回肠中部(两盲肠夹合部)；盲肠扁桃体，在左右回盲口各一处，枣核样隆起，出血(而不是充血)，坏死。鸡新城疫的主要病理变化是全身黏膜、浆膜出血。病死鸡剖检可见口腔、鼻腔、喉气管有大呈混浊黏液，黏膜充血、出血，偶尔有纤维性坏死点。嗉襄水肿，内部充满恶臭液体和气体。食管黏膜呈斑点状或条索状出血，腺胃黏膜水肿，腺胃顶端出血，在腺胃与肌胃或腺胃与食管交界处有带状或不规则的出血斑点。肌胃角质膜下出血，有时见小米粒大出血点。十二指肠及整个小肠黏膜呈点状、片状或弥漫性出血，两盲肠扁桃体肿大、出血、坏死。泄殖腔黏膜呈弥漫性出血。脑膜充血或出血。气管内充满黏液，黏膜充血，有时可见小血点。急性以腺胃乳头有出血点或溃疡和坏死为主要特征。一般全身黏膜充血和出血，呼吸道和消化道充血出血，肌胃角质层下常见出血、胸腺肿大呈灰红色有出血点。鼻腔、喉头和气管内积有大量污秽黏稠液，喉头、充血出血，有的带有假膜。最急性型由于发病急，多数没有肉眼可见的病变，个别死鸡可见胸骨内面及心外膜上有出血点。急性型病变特征明显，口腔中有大量黏液和污物，嗉囊内充满大量酸臭液体和气体，胸腺肿大、有暗红色点状出血。喉头和气管黏膜充血、出血，有黏液。食道和腺胃交界处常见有出血斑或出血带，腺胃乳头肿胀、出血，肌胃角质膜下也可见出血点。典型鸡新城疫主要病理变化表现为全身败血症，以呼吸道和消化道最为严重。嗦囊内充满酸臭液体及气体，口腔和咽喉附黏液，咽部黏膜充血，偶有出血。腺胃黏膜乳头的尖端或分散在黏膜上有出血点，特别在腺胃和肌胃交界处出血更为明显。腺胃黏膜肿胀，肌胃角质层下有出血斑，有时形成粟粒状不规则的溃疡。小肠前段出血明显，尤其是十二指肠黏膜和浆膜出血。盲肠扁桃体肿大、出血和坏死，这种坏死呈岛屿状隆起于粘膜表面。在慢性或非典型病例，直肠粘膜的皱褶呈条状出血，有的在直肠粘膜上可见黄色纤维素性坏死点。