羔羊痢疾由多种病原微生物引起的，其中主要是大肠杆菌、产气荚膜梭菌、沙门氏菌，轮状病毒、牛腹泻病毒等。该病一般发生于7日龄以内的羔羊，以2~4日龄羔羊发病率最高。厌氧性病原微生物，主要是产气荚膜梭菌；非厌氧性的主要有大肠杆菌、沙门氏杆菌、肠球菌、轮状病毒等。不良的环境因素，使羔羊机体抵抗力降低，细菌毒力增强即可发病。如饲养环境阴暗、潮湿，都是引发该病的诱因。圈舍湿度越大，则羔羊发病率越高。初生羔羊不能及时吃上初乳、体格小、体质差、抵抗力弱、自身免疫力低，易引起腹泻。另外，从羔羊本身来说，由于刚刚出生，受环境、气候以及饲养管理的影响较大，如果遇到应激，比如圈舍保温差，羔羊受冻，羔羊吃不饱都会导致羔羊身体抵抗力降低，而促使羔羊痢疾的发生。产羔圈舍简陋，保温设施不配套，温差大，致使羔羊遭受寒冷或贼风刺激，产生应激引起腹泻。饲喂霉烂变质的草料。