羊痘与口蹄疫致病原因不同，发生部位也不同，如羊痘病毒产生羊痘病皮肤表面产生结节，而口蹄疫病毒产生症状是水泡，两种应该有很明显区别，不难区分。羊痘和羊口蹄疫病毒类型不同，临床症状明显不同。羊痘主要表现在鼻，眼等明显部位有凸起的结节疙瘩。羊的口蹄疫病毒在羊身上是储藏器，临床上有发热，食欲减退的现象，典型的症状不明显。羊痘早期皮肤下起豆豆，可以摸到，一般死于肺部感染。羊口蹄疫是流口水，后期继发心肌炎死亡，二者对羊群的危害都很大。
