非洲猪瘟病毒侵入猪体后，首先在鼻咽部或扁桃体中增殖，随后通过淋巴和血液循环进入全身循环系统。病毒在血管内皮细胞和巨噬细胞系统中复制，导致毛细血管、静脉、动脉及淋巴结内皮细胞受损，引发组织器官出血、浆液性渗出等病理变化。
病毒侵入后先在扁桃体增殖，随后进入血液循环形成病毒血症。病毒侵袭血管内皮细胞和巨噬细胞，并复制于这些细胞内。此过程会损害毛细血管、动脉、静脉及淋巴结的内皮细胞，造成相应组织的出血、浆液性渗出、血栓和梗死等病变。同时，病毒感染还导致淋巴细胞凋亡、免疫系统受损和淋巴细胞显著减少。骨髓、肺脏和肝脏是急性感染后病毒复制的重要二级场所。