根据临床症状和常规粪便检查可对本病作出初步诊断。确诊必须通过剖检，观察到球虫性的病理变化，在病变组织中检查到各发育阶段的虫体。另外，在粪便中只有少量卵囊，羊无任何症状，可能是隐性感染。生前诊断必须查到大量球虫卵囊，并伴有相应的临床症状，才能诊断为球虫病。
根据临床表现、病理变化和流行病学可做出初步诊断，确诊需要在粪便中检到大量的卵囊。粪便检查可采用饱和盐水漂浮法检查粪便中的卵囊，也可进行球虫结节的涂片或切片做病原检查，发现大量卵囊或不同发育阶。
根据临床症状和常规粪便检查可对本病做出初步诊断。确诊必须通过剖解观察到球虫性的病理变化，在病变组织中检查到各发育阶段的虫体。另外在粪便中只有少量卵囊，羊无任何症状，可能是隐性感染。生前诊断必须查到大量球虫囊，并伴有相应的临床症状才能诊断为球虫病。
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