主要病理变化为病死羊的真胃粘膜发炎、出血，真胃因水肿而导致胃壁增厚，同时在胃壁上可见大小不一的溃疡灶。病死羊天然孔出血，腹部因胀气发生膨大，可视粘膜呈现紫色。进行病理剖检时可见羊的皮下发生水肿，甚至出现气泡。心脏及胸腔积液，心外膜出血。肝脏肿大，质地变脆。肠道（尤其是盲肠和回肠）出血，有溃疡灶，肠系膜淋巴结肿大。
羊快疫的病理变化:病羊呈现真胃出血性炎症，在胃底部及幽门附近，有大小不一的出血斑块，表面坏死；胸腔、腹腔、心脏大量积液；粘膜下组织常水肿；心内外膜有点状出血；肠道，肺的浆膜下可见出血；胆囊肿胀，死羊若未及时剖检则出现迅速腐败。
病理变化表现为腹内膨胀，口腔、鼻腔和肛门黏膜呈蓝紫色并常有出血斑点，真胃出血性炎症变化显著，尤其是胃底部及幽门附近黏膜常有大小不等的出血斑块和坏死灶。黏膜下组织水肿，胸腔、腹腔、心包有大量积液，暴露于空气中易凝固。肝脏肿大呈土黄色，肺脏淤血、水肿，全身淋巴结，特别是咽部淋巴结肿大、充血、出血。
粘膜充血呈暗紫色。体腔多有积液。特征性表现为真胃出血性炎症，胃底部及幽门部粘膜可见大小不等的出血斑点及坏死区，粘膜下发生水肿。肠道内充满气体，常有充血、出血、坏死或溃疡。心内、外膜可见点状出血。胆囊多肿胀。
病死羊尸体迅速腐败膨胀。剖检可见黏膜充血呈暗紫色。体腔多有积液。特征性表现为真胃出血型炎症，胃底部及幽门部黏膜可见大小不等的出血斑点及坏死区，黏膜下发生水肿。肠道内充满气体，常有充血、出血、坏死或溃瘍。心内、外膜可见点状出血。胆囊多肿胀。
特征性表现为真胃出血性炎症，黏膜充血，肿胀，黏膜下层水肿。肝脏肿大，呈熟土色，胆囊也多肿胀。肠道内充满气体，常有充血、出血、坏死或溃瘍。肾脏软化。
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