羊肠毒血症的病变主要限于消化道、呼吸道和心血管系统。真胃内有未消化的饲料，肠道特别是小肠充血、出血，严重者整个肠段肠壁呈血红色或有溃疡。肺脏出血、水肿，肾脏软化如泥样，一般认为是一种死后的变化。体腔积液，心脏扩张，心内、外膜有出血点。剖检可见真胃含有未消化的饲料,左心室的心内外膜下有出血点,肺腑出血和水肿,肾脏充血、肿胀,比较柔软,胸腺常发生出血,大小肠出血。病程较长病例胃内充满未消化的饲草,胃壁有黏膜脱落和溃疡,腹膜及肠浆膜下有出血斑点,肠管内充满大量气体和少量带血的液体,肠黏膜脱落和溃疡,心脏肿大,心包内有混浊积液,心内外膜有小点出血,肾脏表面充血,实质松软如泥,略加触压即烂,胆囊肿大1~3倍,胆汁较黏稠,小肠壁呈血红色,有的病例有溃疡。脑膜出血，脑组织液化性坏死。