组织学检查发现大脑有变化，灰质和白质均受影响。额部和颞部的变化较明显。神经元发生广泛性坏死并伴有嗜神经现象，神经元周围神经胶质增生和血管套。神经元的变化和坏死通常呈灶性，病灶间距较大，并伴有胶质细胞变性和坏死。在神经组织中很少见到包涵体，在舌、肌肉、肾上腺和扁桃体坏死区可见到包涵体。电镜观察发现在支气管和细支气管的平滑肌细胞、成纤维细胞、淋巴细胞和巨噬细胞中有病毒的核衣壳和病毒粒子。
肺脏呈现轻微水肿，有小块的出血斑，肺门淋巴结周围浸润样水肿、色浅。心脏及冠状脂肪上有细小的出血点,心肌有土黄色条纹状坏死灶。肝脏发黄，有片状红或白色坏死灶，以尖叶部明显。肠系膜淋巴结发红，周边轻微出血。肾脏颜色发黄，易碎，表面有数量不等的细小出血点。脾脏边缘有细小的锯齿样丘疹，颜色鲜红，表面有稍大点的圆形丘疹，颜色略浅。