羊感染包虫病的症状主要表现如下：
一般症状包括食欲减退、贫血、水肿，羔羊腹泻。被毛粗乱，喜卧，起立困难，体重减轻。粪中常混有虫体节片（呈大米粒样，新排出时常可见蠕动）。
感染初期会出现脑部症状：由于病原在脑部引发炎症，表现为脑膜炎或脑炎症状，体温上升，脉搏、呼吸加快。可能出现强烈兴奋、旋转运动、前冲或后退、痉挛性抽搐等症状，也可能出现沉郁、离群躺卧，这些症状以羔羊表现最为明显。
肝包虫病症状：羊出现肝区疼痛、坠胀不适以及上腹饱胀。严重时若虫体阻塞肠管，则出现腹胀和腹疼，可能导致肠道破裂死亡。部分病羊后期出现转圈、肌肉痉挛或头向后仰等神经症状，最终卧地不起，做咀嚼样运动，口周围有泡沫，反应丧失至全身衰竭死亡。